Zasada działania aerodynamicznego Separatora (Wialni, Czyszczalni) ISM polega na separacji sypkiego materiału (nasion wszystkich  roślin uprawnych) w strumieniu powietrza. Wstępne czyszczenie i przygotowanie nasion odbywa się kosztem masy i poprawki na wiatr, co pozwala na wyodrębnienie nasion o wysokich walorach siewnych.

Materiał wyjściowy podawany jest do kosza przyjęciowego, gdzie pod własnym ciężarem rozprowadzany jest na całej szerokości i równomiernie przepływa do komory separacji. Dzięki silnemu laminarnemu przepływowi powietrza w pierwszej kolejności odsiewane są ciężkie zanieczyszczenia i kamienie, które wpadają do pierwszej frakcji. Materiał siewny wpada do drugiej i trzeciej tacy. Czwarta i piąta taca są używana do nasion konsumpcyjnyh. Zanieczyszczenia niezarnowe, wszystkie uszkodzone i pocięte nasiona są odprowadzane przez strumień powietrza do szóstej i siódmej tacy. Powietrze krążące w Separatorze ISM jest oczyszczane, a kurz i lekkie zanieczyszczenia wydostają się przez specjalną tacę.